Индексация медицинского журнала — это процедура включения издания в реестр одной или нескольких наукометрических баз данных: специализированных информационных систем, которые аккумулируют сведения о публикациях, цитированиях и журналах. После включения в базу все статьи журнала становятся доступными для поиска, цитирования и анализа в рамках глобальной научной инфраструктуры.
Термин «индексация» восходит к практике библиографических указателей (индексов), которые составлялись ещё в XIX веке. Сегодня речь идёт о цифровых платформах, автоматически собирающих метаданные: названия статей, аннотации, ключевые слова, списки литературы, сведения об авторах и учреждениях.
Для медицинских изданий наличие индексации равнозначно подтверждению того, что журнал соответствует международным стандартам рецензирования, редакционной этики и оформления публикаций. Без индексации статья, опубликованная даже в авторитетном клиническом журнале, остаётся практически невидимой для большинства исследователей, использующих поиск по базам данных.